Abdus Salam termasuk ilmuan Muslim yang tidak bersetuju dengan gerakan 'Pengislaman Ilmu Pengetahuan", menurutnya, kesahihan kebenaran ilmiah hanya dapat dibuktikan melalui kriteria ilmu pengetahuan itu sendiri, dan bukannya berdasarkan pertimbangan agama metafizik atau estetika. Walau bagaimanapun, komitmen keislaman Salam memang tidak diragukan.